İnece adını Bulgarcada yeni yol anlamına gelen "Novpıt" veya "Yenice" den almaktadır. Çeşitli coğrafik haritalarda köyün adları Enidjiya, Enidje, Enidjiya, İnedje olarak görülür. 

Köy Bulgarlar tarafından kurulmuştur. 1913 yılı Balkan Savaşlarından sonra Bulgar nüfus köyü terk etmiştir. Osmanlıların 14. yy da Kırklareli bölgesini ele geçirdiği dönemde İnece'nin varlığına dair herhangi bir bulguya rastlanmamıştır. 

Ancak, Helvacı Şaban Mevkiinde tarih öncesi devirlere ait bir iki buluntu ele geçirilmiştir. 1677 tarihli bir belgede Kırklareli köylerinden Enidjiya (İnece) iki hane Karahıdır iki hane Iraklisa (Eriklice) dört hane olarak kayıtlara geçmiştir. Bulgar Türkolog Rusi Staykov'un açıklamalarına göre; Türkçede ev anlamına gelen "hane" kelimesinin bir grup ev anlamını taşıdığı ve dolayısıyla bir hanenin on ev olduğu belirtilmektedir. Buna göre İnece köyünde 1677 yılında 20 ev bulunduğu anlaşılmaktadır.

1830 yılında İnece'de 310 Bulgar evi, 1878 yılında 330, ve 1912 yılında 440 ev olduğu bilinmektedir. 1873 yılında 330 ev ve 1918 Bulgar nüfusunun olduğu, 1878 yılında İstanbul da yayınlanan Edirne, Manastır, Selanik Vilayetleri Etnografik İstatistiklerinde geçmektedir. 1912 yılı Lübomit Miletiç istatistiklerine göre köyde 350 ev ve 1075 nüfus mevcuttur. Nüfusun tamamı da Bulgardır. Köy bu dönemde 18 km uzunluk 5-6 km genişliğinde toprak bütünlüğüne sahiptir. 

12 Ekim 1912 yılında İnece Bulgar işgaline uğramış 8-21 Temmuz 1913 yılında tekrar Osmanlı himayesine geçmiştir. Bu dönem sonunda köydeki Bulgar nüfus İnece'yi terk ederek Bulgaristan'a göç etmişlerdir. 1913 yılında Müslümanlığı kabul eden bazı Bulgar aileleri İnece de kalmayı tercih etmişlerdir. Bugün bu aileler bilinmemektedir. Bulgar nüfusun köyü terk etmesi ile Bulgaristan, Yunanistan ve Bosna-Hersek'ten gördükleri zulümden kaçan vatandaşlar köye yerleştirilmiştir. 

1920 yılının Ağustos ayında İnece Yunan işgaline maruz kaldı. Yaklaşık 2,5 yıl süren bu işgal döneminde İneceliler çok sıkıntı çekti ve zulüm gördüler. Bu işgal dönemi 11 Ekim 1922'de imzalanan Mudanya Mütarekesi ile sona erdi. Mütarekeye göre içinde İnce'nin de bulunduğu Doğu Trakya Bölgesi İtalyan ve Fransız yönetimine bırakılacaktı. Ekim ayının sonlarında Yunanlılar Kırklareli ve civarını Fransızlara teslim ettiler. Antlaşma gereği İnece'nin de içerisinde bulunduğu, Kırklareli ve çevresindeki yerleşimlerin birçoğu 10 Kasım 1922'de Türk Jandarmasına teslim edildi. 

20 Aralık 1930 Tarihinde İnece unutulmayacak günlerden birini yaşadı. Kırklareli Ziyaretini tamamlayan Ulu Önder Mustafa Kemal Atatürk Kırklareli'den Edirne'ye hareket etti. İnece'den geçerken yolu kapatan İnece halkı Ulu Önder Atatürk'ün çok kısa sürede olsa İnece topraklarına ayak basmasını ve onunla sohbet etme fırsatını yakalamış oldu. 26 Şubat 1954 tarihinde ise İnece Köyü Bakanlar Kurulu Kararı ile Belediye oldu.